1．具有抗肿瘤作用的微管动力蛋白Eg5抑制剂的全新设计、合成和生物活性研究  国家自然科学基金（30772624）  课题负责人

2．心肌延迟整流钾通道的生物信息学与先导化合物的发现研究   国家科技部“863”计划项目（课题号：2007AA02Z307）  课题负责人

3．调控肿瘤干细胞凋亡的信号转导通路研究及化学小分子探针的构建   国家自然科学基金重大研究计划项目（90713038）  课题负责人

4．抗肿瘤及糖尿病等药物研究与开发技术体系建设   “重大新药创制”科技重大专项（2008ZX09401-001）  子课题负责人

5．针对重大疾病的先导化合物结构优化设计的关键技术研究   “重大新药创制”科技重大专项（2009ZX09501-003）  课题负责人